SIMEONI Marta

Position Researcher
Telephone 041 234 8475
E-mail simeoni@unive.it
Scientific sector (SSD) INFORMATICA [INF/01]
Website www.unive.it/persone/simeoni (personal record)
 http://www.dsi.unive.it/~simeoni
Office Department of Environmental Sciences, Informatics and Statistics
Website: https://www.unive.it/dep.dais
Where: Campus scientifico via Torino
Room: office Z.B16 (Zeta B building)
Office European Center for Living Technology (ECLT)
Where: Ca' Bottacin
Research Institute Research Institute for Complexity

Dati relazione

Periodo di riferimento 01/09/2015 - 01/09/2018
Afferenza Dipartimento di Scienze Ambientali, Informatica e Statistica
Ruolo Ricercatori universitari

Attività didattica

A.A.InsegnamentoCodice Voto (max 4)Voto medio area (max 4)
2015/2016ARCHITETTURA DEGLI ELABORATORICT00053.13.1
2015/2016ELEMENTI DI INFORMATICA PER L'ECONOMIAET00322.73.1
2016/2017ARCHITETTURA DEGLI ELABORATORICT00053.23.1
2016/2017ELEMENTI DI INFORMATICA PER L'ECONOMIAET00322.83.1
2017/2018ARCHITETTURA DEGLI ELABORATORICT00052.83.2
2017/2018BIOINFORMATICSCM01902.43.2

Tesi

Anno solareTipologiaTesi RelatoreTesi Correlatore
2016Corso di laurea1
2016Corso di laurea magistrale2
2017Corso di laurea1
2017Corso di laurea magistrale1

Ricerche sviluppate e in corso

  • Biologia Computazionale

Pubblicazioni realizzate nel triennio

  • Baldan, Paolo; Bocci, Martina; Brigolin, Daniele; Cocco, Nicoletta; Monika, Heiner; Simeoni, Marta (2018), Petri Nets for Modelling and Analysing Trophic Networks in FUNDAMENTA INFORMATICAE, vol. 160, pp. 27-52 (ISSN 0169-2968) (Articolo su rivista)
  • Baldan, Paolo; Bocci, Martina; Brigolin, Daniele; Cocco, Nicoletta; Simeoni, Marta (2015), Petri nets for modelling and analysing trophic networks , Biological Processes & Petri Nets 2015 in CEUR WORKSHOP PROCEEDINGS, CEUR-WS.org, vol. 1373, pp. 21-36, Convegno: BioPPN15, June 22, 2015 (ISSN 1613-0073) (Articolo in Atti di convegno)

Descrizione dell'attività di ricerca svolta nel triennio e gli obiettivi futuri

The main line of research in the last three years is in Ecoinformatics and
concerns the representation and analysis of different types of ecological networks, such as trophic networks or food webs (a kind of network representing feeding interactions - what-eats-what - in an ecosystem) and ecosystem services (a network representing the interactions between ecosystem structure and processes that underpin the capacity of an ecosystem to provide goods and services).
A very recent research interest is in the field of protein analysis and comparison. In particular, I'm interested in analysing and comparing proteins through their Residue Interaction Network (RIN), that is the graph obtained from the 3D structure by taking amino acids as nodes and their interactions as edges.

Altri prodotti scientifici

Partecipazione ai progetti europei:
- EQUAL-IST
- MASTER

Relazioni invitate presso convegni o workshops

Workshop BioPPN 2015 - Bruxelles, June 22, 2015
M. Simeoni
"Petri nets for modelling and analysing Trophic networks"(presentazione del lavoro)

Convegno: “Un mercato unico digitale per l’Europa: competenze digitali nell’Industria 4.0”, Università Ca’ Foscari Venezia, 8 Novembre 2016
T. Scantamburlo, M. Simeoni
Competenze digitali nella società dell’informazione (presentazione su invito)

Seminari su invito tenuti presso altre Università, Centri di Ricerca, Aziende, etc.

09.03.2018 seminario su invito presso l'Università de L'Aquila, "Petri nets for modelling and analysing Trophic networks"

Altre attività scientifiche

Organizzazione convegno
INFOLIFE2017, CINI InfoLife Laboratory Workshop
Venice (Italy), September 21-23 2017
http://infolife.dais.unive.it/

2018 Membro della Commissione finale di dottorato in Informatica
Candidata Ana Lucia Schmidt
IMT Lucca

Incarichi accademici e attività organizzative

- Presidente della BAS - Biblioteca d'Area Scientifica - per tutto il periodo
- Organizzatore dei Coderdojo@Ca'Foscari - 5 eventi l'anno dal 2015 ad oggi
- Promotore di Ca' Foscari Digitale - Informatica 7-13 anni - dal 2016

Componente di Collegi didattici, Comitati e Commissioni di Dipartimento, Commissioni di Ateneo

Componente del collegio didattico di Informatica da Ottobre 2018

Altre informazioni

Altro prodotto della ricerca del triennio è il seguente articolo, accettato il 12 novembre 2018 e pubblicato online il 16 novembre 2018. Inserito poi nel volume del 10 Marzo 2019:

Rova, Silvia; Meire, Patrick; Müller, Felix; Simeoni, Marta; Pranovi, Fabio A Petri net modeling approach to explore the temporal dynamics of the provision of multiple ecosystem services in SCIENCE OF THE TOTAL ENVIRONMENT, vol. 655, pp. 1047-1061 (ISSN 0048-9697) (Articolo su rivista)
https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2018.11.184